DNA濃度計算ツールの使い方
DNA濃度計算ツールは、NanoDropや分光光度計などの測定機器で得られたA260吸光度をもとに、核酸濃度（dsDNA・ssDNA・RNA）および純度をすばやく手動計算・検証できるオンラインツールです。
- 核酸のタイプを選択 — dsDNA（二本鎖DNA）、ssDNA（一本鎖DNA）、RNAの中から測定対象を選択します。選択された核酸に応じた正しい換算係数が自動的に適用されます。
- 吸光度 A260 を入力 — 260 nmの波長で測定した吸光度（A260）の数値を入力します。
- 希釈倍率を入力 — 測定前にサンプルを希釈した場合は、その希釈倍率を入力します（例: 10倍希釈の場合は「10」、無希釈の場合は「1」）。
- 吸光度 A280 を入力（任意） — A260/A280の純度比を算出したい場合は、280 nmでの吸光度を入力します。
計算結果は µg/mL および ng/µL（数値上は同一値）の両方で表示され、A280を入力した場合は純度評価バッジも合わせて確認できます。
DNA濃度の計算公式と理論背景
DNA濃度計算は、260 nmにおける紫外線吸光度と核酸濃度との間に成立する以下の実験的関係式に基づいています。
核酸濃度 (µg/mL) = 吸光度 A260 × 換算係数 × 希釈倍率| 核酸のタイプ | 換算係数（吸光係数） |
|---|---|
| dsDNA（二本鎖DNA） | 50 µg/mL / A260 単位 |
| ssDNA（一本鎖DNA） | 33 µg/mL / A260 単位 |
| RNA | 40 µg/mL / A260 単位 |
これらの係数はWarburgおよびChristianらによって確立されたもので、光路長 1 cmのキュベットでA260が1.0を示すときの各核酸の濃度を表しています。
1 µg/mL = 1 ng/µL であるため、本ツールでは実験手順に合わせて両方の単位を同時に表示します。
A260/A280 純度評価の基準
A280の値を入力すると、ツールは以下のA260/A280純度比を算出します。
A260 / A280 純度比 = A260 の値 ÷ A280 の値- 高純度 dsDNA: 1.8 – 2.0
- 高純度 RNA: 1.8 – 2.1
- 1.8 未満: タンパク質やフェノール、カオトロピック塩の混入が疑われます
- 2.1 超（DNAサンプル）: RNAの混入（キャリーオーバー）が疑われます
DNA濃度計算ツールの活用事例
本DNA濃度計算ツールは、分子生物学や遺伝子工学の幅広い実験で活用されています。
- ゲノムDNA抽出生出物の定量確認 — フェノール・クロロホルム抽出やカラム精製後の収量および純度を迅速にチェック。
- PCR・qPCRテンプレートの濃度調製 — 定量PCRの再現性を高めるため、増幅前にテンプレートDNAを均一な濃度に調整。
- 次世代シーケンシング（NGS）ライブラリー調製 — 入力量が厳格に求められるNGS解析前の正確なDNA量確認。
- プラスミドDNAの定量 — ミニプレップやマキシプレップ後のプラスミド濃度を測定し、トランスフェクションやクローニング実験へ活用。
- RNA抽出物の品質評価 — 逆転写反応（RT-PCR）やRNA-seqの前に、RNA濃度と純度比を手軽に評価。