如何使用蛋白质分子量计算器
蛋白质分子量计算器利用标准残基质量从氨基酸序列中计算蛋白质的理论分子量，适用于凝胶电泳实验设计、质谱数据分析和生物化学研究。
- 选择分子量类型 — 选择平均分子量或单同位素分子量。
- 输入氨基酸序列 — 使用单字母氨基酸代码输入或粘贴蛋白质序列（如ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY）。非标准字符和空格将被自动忽略。
- 查看结果 — 蛋白质分子量计算器显示以Da和kDa为单位的分子量、序列长度，以及各氨基酸数量和占比的组成分析表。
蛋白质分子量计算器支持任意长度序列，所有计算均在浏览器中完成。
公式与原理 - 蛋白质分子量计算器
蛋白质分子量计算器 使用的核心公式或规则采用标准残基质量累加公式：
分子量 = Σ（残基质量 × 数量）+ H₂O其中每种氨基酸的残基质量等于该氨基酸分子量减去水分子（因为肽键形成时脱去水分子）。最终加回一个水分子，以反映完整多肽链自由氨基端和羧基端的贡献。
| 符号 | 含义 |
|---|---|
| 残基质量 | 氨基酸分子量减去H₂O（Da） |
| H₂O | 18.01524 Da（平均）或 18.01056 Da（单同位素） |
| Σ | 对序列中所有残基求和 |
部分氨基酸残基质量示例（平均值）：
| 氨基酸 | 代码 | 残基质量（Da） |
|---|---|---|
| 甘氨酸 | G | 57.05 |
| 丙氨酸 | A | 71.08 |
| 色氨酸 | W | 186.21 |
假设与局限
本计算器使用标准未修饰残基质量，不考虑二硫键、糖基化、磷酸化、信号肽切割或任何其他翻译后修饰。计算结果为线性未修饰肽链的理论质量。
蛋白质分子量计算器的使用场景
蛋白质分子量计算器在分子生物学、生物化学和生物医学研究中有广泛应用：
- SDS-PAGE实验设计 — 在跑胶前估算重组蛋白的预期迁移位置。
- 质谱数据解析 — 计算前体离子的理论质量，用于数据库搜索和肽段鉴定。
- 蛋白质表达验证 — 将理论质量与Western blot或质谱观测值对比，确认蛋白质的正确表达和加工。
- 生物学教学 — 学习蛋白质结构的学生可通过此工具将氨基酸组成与分子量概念建立直观联系。